Ngự Y Heo Jun lấy bối cảnh thời Joseon, chủ yếu là dưới thời trị vì của vua Seonjo. Câu chuyện này xảy ra sau cái chết của Dae Jang Geum (nữ ngự y đầu tiên của thời kỳ Joseon) 50 năm. Nó miêu tả cuộc sống của ngự y Heo Jun, người đã viết sách y thuật  phương Đông "(Đông Y Bảo Giám)" và trở thành ngự y cho vua Seonjo. 

Kim Joo Hyuk sẽ đóng vai Heo Jun trong bộ phim này. Yoo Ui Tae (Baek Yoon Shik) người cố vấn của Heo Jun là người ảnh hưởng lớn nhất trong cuộc sống của ông ấy. Ye Jin Ah (Park Jin Hee) là một phụ nữ bị mất cha mẹ khi tuổi còn trẻ nhưng được Yoo Ui Tae nuôi dưỡng, và lớn lên được học y thuật từ Heo Jun. Cuối cùng cô ấy đã trở thành một y nữ hoàng tộc và nghiên cứu y thuật cùng với Heo Jun và cả hai đã yêu nhau và trở thành ngự y cho vua Seonjo. (chủ trị y quan của vua Seonjo)